一路由贝勒阿济格、多尔衮、多铎统领，率正白旗固山额真昂邦章京阿山、镶白旗固山额真梅勒章京伊尔登等，及蒙古阿录翁牛特诸部兵马，自巴颜朱尔格地方，进入龙门，会兵于宣府下应县至大同。
还有一路由皇太极亲自率领贝勒阿巴泰、豪格、杨古利诸将领，及正黄旗，镶黄旗，天佑、天助两部汉兵入尚方堡，由宣府攻略朔州一带，并且议定七月八日各路大军俱毁边墙入关。
皇太极的使者也进入了陕西，却并没有见到李鸿基，李鸿基已率军到了榆林的蒙缰边境，此时闯军中所有人都知道了闯王的心意，对这两个使都自然没有好脸色，甚至有人主张杀了，但此体到底事大，如何处理还需问过闯王，周凤梧把两人凉了起来。
虽然朝庭的大军声势浩大，但李鸿基的重军却集结在榆林，在消除了闯军境内的隐患后，闯军取得了充足的钱粮，又扩充了五个军，闯军的机动力量增加到十五万人。
除了四个野战军在祁县前线和陈奇榆对持外，二个军增援宝鸡，防备甘肃的董学礼，还有三个军驻扎在各地重镇，而在陕西的蒙古边境集聚了六个军，加上地方守备，后勤人员总共达十二万大军。
李鸿基如此安排军力，自然遭到参谋部的一至反对，虽然闯军的情报人员已经渗透进了草原，知道后金已进入了蒙古，但许多人都认为这正是天赐良机，刚好可以与满人同时攻打大明，将朝庭集结的军队一济消灭。
李鸿基听得大怒，虽然他知道后世的满人也是中国的一部分，但他深知满人对中华民族带来的大灾难，这不仅仅是指满金入关导致中国的人口由二亿多减至四千来万，他还使中华民族的文明倒退了数百年，使得二十一世纪中国还远远落后于西方国家，何况这次满人进入内地的唯一目的就是烧杀抢掠，若不给他一点教训，满人的气焰只会越来越嚣张。
李鸿基只好同自己的参谋部大讲华夷之辨，闯军和大明是兄弟之间打架，谁胜谁负都不要紧，而满人是外贼，想趁人家家里不和，前来打劫，当然要先打跑外人，众人见李鸿基坚持也不好再反对。
其实当时的士子把华夷之防看得比现在重得多，宋献策，洪承畴他们所以反对先和满人交恶，不是因为对满人经常侵入内地烧杀抢掠不愤慨，只时他们认为现在闯军的大敌首先是朝庭，并不认为满人能给汉人带来多大的伤害，无非是抢点，烧点，反正他们打击的是朝庭，和闯军并无关系。
但李鸿基却深知不能任由满人发展下去，林丹汗远逃，虽然身边还有数万人，但对他的威望是个重大的打击，估计就是不死，恐怕再也无法和满人争雄，若任由满人顺利统治蒙古各部，再建立汉军八旗，那时实力必定大增，闯军以后即使推翻了大明，也得面临与满人的争峰，何况这次李鸿基提前与满人交手也想让闯军知道一下满人的实力，知已知彼方能百战不殆。
李鸿基在蒙古边境集结重兵的另一个目的就是趁机拉拢蒙古的小部落，虽然在后来的历史上蒙古人一直是满清的坚定拥护者，但此时真正归获后金的部落还不过半，归附的也不全是真心实意，只是惧于后金的强大而已，蒙古和女真其实是世仇，1467年，成吉思汗的第27代继承人满都古勒大汗在讨伐他的侄孙和继承人博勒呼济农的一次战争中去世。而博勒呼济农在1470年也被暗杀。一度人丁兴旺的黄金家族中，现在仅剩下一个5岁的男孩、博勒呼济农之子达延。
达延的命运比成吉思汗年幼时的遭遇还要悲凉和不幸，家族的长辈都在内讧中死去，小小的孩子孤苦无依，连他的母亲都抛下他改嫁了，所幸，满都古勒汗的年轻遗孀满都海赛音可敦把他置于自己的保护之下，还在1470年宣布他为大汗，满都海赛音可敦是一个了不起的女人，她不但抚养了达延，还率领军队打败了卫拉特人，将他们彻底赶出了蒙古中东部地区。为达延汗日后的统治奠定了基础。
达延汗是蒙古帝国统治时间最长的大汗，统治了蒙古整整七十三年。在1481年亲政之后，达延汗镇压了右翼土默特人、兀良哈人的叛乱。并从1497年到1505年间，他对从辽东到甘肃的明朝边境地区进行了一系列卓有成效的攻击，使得明朝无法与卫拉特人联系。
1543年达延汗去世之后，他的孙子博迪继承了汗位。虽然广大的领土被达延汗的众多子孙瓜分，但从1544年到1634年蒙古帝国的汗位一直稳固的在达延汗的长支后裔察哈尔部中传承。
虽然达延汗的长期统治稳定了蒙古帝国汗位传承，但并没有克服蒙古民族的最大弱点——实行瓜分家族遗产的习惯法。当帝国的创建者死后，帝国便成了一种类似联邦式的家族国家，国内的各级首领，都是兄弟或堂兄弟，他们虽然承认察哈尔部的最高权利，但处于相当的独立状态。
随着时间的流逝，察哈尔部的汗位继承者们逐渐失去了足以统治整个蒙古的力量，西方的卫拉特人和东方兴起的通古斯人（满人）都是他们可怕的敌人。但这个时候，卫拉特人正在对付哈萨克汗国、沙皇俄国以及内部的绰罗斯家族与和硕特家族的权力争夺。
1604年，林丹继承汗位，接受黄教沙尔巴呼图克图的灌顶戒教，称林丹库图克图汗。林丹汗并不是一个昏庸无能的可汗，他早已看出后金帝国对于蒙古的野心，因此从继位始，便开始重新统一蒙古各部。
1616年，比林丹汗年长33岁的努尔哈赤登上后金汗位。而后来继承汗位的天聪汗皇太极与林丹汗同岁，他成了蒙古林丹汗的克星。