第一节：雾锁迷舟
咸腥海风卷着细雨，张翠山扶着桅杆极目远眺。这艘载满南洋香料的商船已在东海漂了七日七夜，罗盘针疯转如陀螺。夜色浓时，忽见远处有幽蓝磷光浮动，隐约传来《广陵散》琴音。老船工突然跪地颤抖：侠客岛...是侠客岛的引魂灯！
船身猛然剧震，张翠山抓住缆绳的瞬间，望见磷火中浮现二十四面石壁，每面皆刻人体经络图。正待细看，巨浪已将商船拍向礁石。昏迷前最后一眼，瞥见白衣人踏浪而来，袖口金线绣着北斗天罡。
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第二节：石壁玄机
再醒时身处石窟，壁上蝌蚪文游走如活物。张翠山以武当梯云纵掠上石梁，惊觉这些文字竟随视角变化重组。当他倒立观瞧时，云手三式突然化作太虚引心法，与张三丰所授截然相反。
暗河深处传来铁链声响，披发老者蜷在寒玉床上，足踝拴着玄铁链。见张翠山佩剑，老者突然狂笑：又来一个送死的！挥掌击向石壁，裂纹中渗出荧蓝液体，竟在空中凝成《太玄经》残句：五岳倒为轻...
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第三节：岛主谜云
白衣人再次现身，自称天微星君。张翠山与之过招，发现其掌法似少林般若掌，却又夹杂古墓派轻功。激斗间扯下对方半幅面具，露出的疤痕竟与俞莲舟当年描述的谢逊刀痕相似。
月圆之夜，张翠山跟踪白衣人到祭坛。见其向北斗七星跪拜，口中念着：恭贺教主练成神功...坛下密室传出婴儿啼哭，数百具水晶棺列阵如星河，棺中皆是与自己年龄相仿的男子尸身，心口黥着武当太极图。
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第四节：逆运玄功
参悟石壁三月，张翠山发现蝌蚪文实为倒写梵文。当他逆运纯阳无极功，文字突然离壁飞舞，在气海穴形成漩涡。原属手太阴肺经的中府穴，竟与足少阳胆经环跳穴相连。
披发老者突然狂性大发，铁链崩断袭来。张翠山以逆运的梯云纵闪避，老者招式却愈发熟悉——竟是武当绵掌的倒行版！制住老者后，在其后颈发现消失二十年的三师兄俞岱岩的刺青。
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第五节：星宿杀阵
为追查真相，张翠山夜探磷火海域。海底沉船中寻得航海日志，记载永乐年间郑和船队曾在此失踪。更骇人的是，舱内壁画描绘着张三丰与八臂神剑方东白对决场景，题字却是恩师张真人赐教于侠客岛。
返回途中陷入北斗七星阵，七名岛众各持怪异兵器。张翠山以逆运的神门十三剑破阵，发现他们使的竟是各派失传绝学：峨眉的金顶佛光、昆仑的混沌剑阵...最后一人使出武当震山铁掌，袖中滑落殷梨亭的玉佩。
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第六节：婴棺疑冢
闯入水晶密室，棺中婴儿突然睁眼，瞳孔泛着金芒。张翠山以真气探查，惊觉这些婴儿任督二脉天生贯通，气海穴却呈北斗七星排列。最深处棺椁刻着张无忌三字，生辰八字与自己推算的孙儿出生日完全吻合。
天微星君率众杀到，张翠山夺路而逃时触动机关。整座岛开始震动，石壁蝌蚪文化作火龙追击。危急时刻，披发老者现身相救，撕开胸前皮肉露出玄铁令牌——正是明教失踪多年的圣火令。
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第七节：往世轮回
老者实为三十年前明教光明左使杨逍！他道出骇人秘辛：侠客岛乃波斯明教总坛遗址，岛主是张无忌前世之身。那些水晶棺中的尸身，皆是历代转世失败的伪明尊。
石壁武学源自《太玄经》波斯译本，张三丰百年前曾来此闭关。杨逍指向最高处石龛，那里供奉着半部《九阳真经》，经页批注笔迹与张翠山幼时临摹的父亲手书如出一辙。
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第八节：星坠明尊
天微星君发动太虚引大阵，整座岛开始下沉。张翠山逆运纯阳功对抗，发现海底火山口竟是个巨大浑天仪。杨逍以圣火令启动机关，二十四面石壁合拢成《太玄经》全本，文字在空中凝成张三丰虚影。
虚影道出惊天秘密：百年前他与波斯智者共创《太玄经》，为阻秘籍落入元廷，将其拆解刻于侠客岛。所谓实为经书守护灵，每甲子需夺舍重生。此刻夺舍目标，正是尚未出生的张无忌！
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第九节：剑破太虚
海啸吞没岛屿前，张翠山悟出正逆合一的太极太玄功。剑气劈开浑天仪核心，其中跌出个青铜匣，匣内羊皮记载着真正的《太玄经》——竟是张三丰与郭襄年轻时的书信集！
天微星君面具崩裂，露出的面容令张翠山肝胆俱裂：那竟是与自己一模一样的脸！原来所有闯入者都会被复制记忆，成为候选。危急时刻，杨逍以圣火令刺穿浑天仪，带着张翠山跃入救生舟。
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尾声：武当山月
三年后武当山巅，张翠山凝视着殷素素怀中婴儿。那孩子掌心天生北斗红痣，与水晶棺中如出一辙。紫霄宫传来张三丰的叹息：翠山，你带回的究竟是终结...还是新的轮回？
月光照在殿前石碑，当年从侠客岛带回的青铜匣突然开启，空无一物的内壁上，渐渐浮现出蝌蚪文的最后一句：侠客岛永不沉没。