就在战斗胶着之时，守护者注意到生物群的移动似乎存在某种规律，像是受到某个信号的指引。他猜测可能存在一个控制者，于是让队员们集中扫描周围区域。很快，他们发现了一个隐藏在能量波动中的小型核心装置。守护者果断下令发射精准导弹，一举摧毁了装置。那些生物瞬间失去控制，开始四处乱窜。队员们趁机加大攻击力度，将它们逐个消灭。可宇宙的深邃中，又有未知的阴影在悄然浮现，新的危机正慢慢逼近。
守护者刚指挥队员清理完战场，战舰的警报声又急促响起。雷达显示，前方出现一片巨大的黑色雾团，正以惊人的速度扩张。雾团所过之处，空间似乎都被扭曲，所有的探测信号进入其中便消失得无影无踪。守护者深知，这又是一场前所未有的挑战。他下令战舰保持距离，同时派出小型侦察舰靠近雾团收集样本。侦察舰刚接近雾团边缘，就被一股强大的吸力拉扯，舰身剧烈摇晃。好不容易采集到样本后，侦察舰匆忙返回。分析结果让众人倒吸一口凉气，这雾团竟是由无数微小的纳米机械组成，它们能吞噬一切能量并自我复制。守护者迅速制定策略，决定利用战舰的电磁脉冲武器扰乱纳米机械的信号连接。队员们紧张地操作着设备，随着电磁脉冲波的释放，雾团的扩张速度明显减缓。但就在众人以为取得成效时，雾团突然重新聚合，形成一个巨大的机械巨兽，张牙舞爪地朝战舰扑来。
守护者心中一紧，但很快镇定下来，他迅速调整战术，命令战舰发射高能激光束，试图切割巨兽的肢体。激光束击中巨兽，却只激起一阵火花，并未对其造成实质性伤害。巨兽发出一声怒吼，伸出巨大的机械臂，狠狠砸向战舰，剧烈的震动让舰内设备纷纷摇晃。就在这千钧一发之际，守护者突然想到纳米机械依赖能量运转，或许可以切断其能量源。他果断下令关闭战舰部分非必要能源系统，同时利用引力发生器制造强大的引力场。引力场成功吸引了巨兽部分纳米机械，使其身形出现短暂失衡。队员们抓住时机，集中火力攻击巨兽的核心部位。经过一番激烈战斗，巨兽的核心闪烁出不稳定的光芒，最终轰然解体，重新散成雾团。然而，雾团并未消散，而是迅速重组，再次形成新的形态，一场更为艰难的战斗似乎才刚刚开始。
新形成的形态竟是一群灵活的小型机械飞虫，它们密密麻麻地朝战舰涌来，瞬间便将战舰包裹。飞虫们开始啃噬战舰的外壳，警报声此起彼伏。守护者明白，常规武器对这些小而灵活的飞虫效果不佳。他灵机一动，想到纳米机械虽能自我复制，但需要能量和物质。于是，他下令开启战舰的诱饵系统，释放出大量富含能量的虚拟信号。