极尽哀荣
贞观十六年，魏徵的健康状况显着恶化，皇帝李世民对此深感忧虑，并亲自下诏慰问。诏书中说：“数日不见，朕已觉缺失良多。欲亲往探视，恐加重劳顿。若有任何需要，随时上书。”
尽管病痛缠身，魏徵仍然心系国事，再次进言，指出太宗皇帝在朝会上常常强调公正无私，然而实际行动中却未能完全做到言行一致。
在此期间，太宗李世民频繁派遣使者前往问候，还让一名中郎将驻守魏家，以便随时奏报魏徵的病情。为了表彰魏徵一生的清廉简朴，李世民决定将原本用于建造自己宫殿的材料转赠给了魏徵，用以修建正堂，并赠送了符合其简朴生活的白色褥子和布被，以此满足他崇尚简朴的心愿。
随着魏徵的病情日益严重，李世民不仅亲自前去探望，还携太子李承乾与嫡女衡山公主（即新城公主）一同前往，彰显了他对这位忠臣的敬重。面对即将离世的魏徵，李世民悲痛不已，一边抚摸着魏徵一边流泪，承诺将衡山公主许配给魏徵之子魏叔玉，并指着衡山公主对他说：“魏公，睁开眼睛看看你的儿媳！”但此刻的魏徵已经身体衰弱到无法起身谢皇帝的大恩了。
魏徵去世之后，李世民悲恸万分，宣布废朝五日以示哀悼，并下令内外百官及长安的朝集使共同参与丧礼。追赠魏徵为司空、相州都督，赐谥号“文贞”，并给予丰厚的陪葬品，允许其墓地位于昭陵旁。
然而，魏徵的妻子裴氏遵循他生前节俭的意愿，婉拒了大部分官方提供的奢华丧葬安排，选择了一辆简单的素车来运送灵柩，仅用白布、帷幕装饰，也没有使用过多的花纹、色彩和刍灵。李世民登上御苑西楼遥望送行，命令百官护送灵柩出城，并亲自撰写碑文，创作挽词十首纪念这位杰出的大臣。为了进一步表达他的怀念之情，李世民又赐予魏家九百户封地，以表彰魏徵的贡献。
身后余波
贞观十七年（643年）二月，李世民下令将左少监阎立本绘制长孙无忌、李孝恭、杜如晦等二十四位功臣的画像，并将这些画像安置于凌烟阁，此即着名的“凌烟阁二十四功臣”，魏徵位列其中第四。面对魏徵的画像，李世民思绪万千，当场吟诵道：“劲条逢霜摧美质，台星失位夭良臣。唯当掩泣云台上，空对余形无复人。”表达了他对魏徵深深的怀念与惋惜。
不久之后，太子李承乾谋反案爆发，侯君集因参与谋反被处决；中书侍郎杜正伦受牵连而被远贬。魏徵曾经向李世民推荐这二人，称他们有宰相之才，但此时，李世民开始怀疑魏徵是否结党营私。加之魏徵曾写下自己前后的谏辞给史官褚遂良查看，李世民知晓此事后更加不满，因此手诏取消了衡山公主与魏叔玉的婚约，并下令推倒了魏徵的墓碑。
然而，在贞观十九年（645年），李世民亲自率军征讨高丽（即高句丽）。尽管取得了胜利，但他未能彻底征服高丽，心中满是遗憾和后悔。回师之后，他感慨地说：“如果魏徵还在，一定不会让我做出这样的决定。”于是，李世民召见魏徵的家人到行营，赏赐并慰劳裴氏，命令立刻以少牢之礼祭祀魏徵，并重新树立起他的墓碑，以此表达对这位昔日贤臣的追思和敬意。
主要影响
魏徵经历了多次丧乱，仕途充满波折，丰富的阅历铸就了他卓越的治国才能。他对社会问题有着敏锐的洞察力，并以耿直不阿、坚韧不拔的态度面对一切事务，深得唐太宗李世民的器重。据《贞观政要》记载，魏徵向李世民当面提出的谏议多达五十次，呈交的奏疏有十一件，一生中谏诤的言辞总计超过了数十万字。无论是在谏议次数、言辞的激切程度还是态度的坚决性上，都远超其他大臣。总结魏徵的政治思想，主要体现在以下几个方面：
1. 极言直谏，剖析得失：魏徵的谏诤范围广泛，朝廷军国大事中的失误是其上谏的重点内容。为了恢复隋末战乱后的社会秩序，他建议李世民实行与民休养生息的政策，改变隋炀帝时期的奢靡风气，反对过度建设和频繁对外用兵；为确保社会稳定，他提倡废除隋朝的严刑峻法，代之以更加温和公正的法律体系；为了政治清明，他强调用人标准应兼顾德行和才能，对于贪污腐败的官员必须严厉惩处。
2. 在刑赏问题上的见解：在魏徵看来，刑罚和奖赏的根本目的在于鼓励善行和惩罚恶行，在法律面前，“贵贱亲疏”应当一视同仁，确保公平正义得以实现。
3. 对君主思想作风的规劝：魏徵提醒李世民要“兼听则明，偏信则暗”，即广泛听取不同意见，避免被少数权臣蒙蔽，从而阻碍下情上达。他还告诫李世民以隋朝灭亡为鉴，吸取历史教训，保持警醒，防止骄奢淫逸的生活方式侵蚀国家根基。
魏徵的这些谏言不仅体现了他对国家命运的深切关怀，同时也展现了他对政治治理深刻而独到的理解。他的智慧和勇气，使得他在历史上留下了不可磨灭的一笔。
偃革兴文，与民休息
魏徵鉴于隋末社会动荡、人口流亡、经济凋敝、百废待兴的严峻现实，力劝唐太宗李世民偃武修文，推行有利于国计民生的休养生息政策。这体现了他政治上的“致化”思想——即通过温和的方式达到教化民众的目的。
李世民即位之初，曾与群臣讨论如何教化百姓。他认为经历大乱之后，恐怕难以对百姓进行有效的教化。然而，魏徵持有不同的观点：
“久安之民容易骄纵，骄纵则难以教化；但经历过混乱的百姓因愁苦反而更易接受教化。”
他以“饥者易为食，渴者易为饮”来比喻这一点，并反驳了大臣封德彝关于人性逐渐变坏，因此秦朝依赖法律、汉朝杂用霸道的观点，认为商汤灭夏桀、周武王伐纣后都能实现太平盛世，正是在大乱之后承平天下的例子。他还进一步指出，如果认为古人淳朴而今人浇薄，那么到了今天人们岂不是都变成了鬼魅？君主又怎能治理这样的国家？李世民采纳了魏徵等贤臣的建议，制定了经国治世的基本国策，这对后来的贞观之治产生了深远的影响。